土壤診斷還應查看土壤表面，該方法是將患病植物的田地與正常植物的鄰近土壤田地進行比較，以查看是否存在差異。如果是鹽堿危害，則在一般植物病害區(qū)的地塊表面會有更多的鹽分累積或明顯的鹽分偏移，并可以初步確認診斷。但是，對于土壤養(yǎng)分，植物表現(xiàn)出缺乏某些養(yǎng)分或中毒的癥狀，肉眼無法判斷，有癥狀區(qū)域的土壤表面與正常區(qū)域之間沒有差異，需要借助土壤多參數(shù)測量儀進行檢測。
土壤多參數(shù)測量儀診斷時，不僅是農(nóng)作物的地上部分和土壤表面，還包括農(nóng)作物的地下部分的癥狀和土壤狀況，即從農(nóng)作物和土壤中分析病因。從總體上講，更正確地獲得了土壤與農(nóng)作物之間的生理協(xié)調關系，如土壤排水不良，通透性差，土壤中的有毒物質容易積聚在表層，一般農(nóng)作物的根系又小又短。
在這種情況下，即使少量的新根是白色或棕色，而大多數(shù)根是黑色或爛根，整個農(nóng)作物也會顯得脆弱或枯萎。當土壤干燥時，根部吸收水分進入深層土壤，并且根部分布較深。當土壤表面潮濕時，土壤溫度較低。但是，根系很短，并且大部分分布在表層。只有質地輕薄或深耕的土壤和根系才更均勻地分布。側根很多，表皮光滑且無彎曲變形。由上可知，作物根系的生態(tài)變化是土壤某些特征的客觀反應，是土壤診斷的重要方面。
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